Savukārt vācieši, zinādami kureliešu patiesos nolūkus, jo Kureļa štābā atradās vairāki vācu ziņotāji, sāka apsvērt domu par vienības likvidāciju. 1944. gada 14. novembrī vācu SS un SD vienības aplenca kureliešu galvenos spēkus Puzes pagasta „Stiklos” un arestēja. Astoņi J. Kureļa štāba virsnieki, tai skaitā K. Upelnieks, 20. novembrī tika nošauti jūras kāpās pie Liepājas, bet daudzi simti nonāca koncentrācijas nometnēs.
Aktīvu pretestību vāciešiem izrādīja Kureļa grupā ietilpstošais leitnanta Roberta Rubeņa bataljons apmēram 500 vīru lielumā, kas bija izvietots Abavas upes rajonā. Rubeņa vīri atsita vairākus vācu uzbrukumus, līdz pārspēka mākti, dzīvi palikušie izklīda, noejot pagrīdē vai pievienojoties padomju partizānu vienībai „Sarkanā bulta”, ar kuru vairākas reizes jau bija kooperējušies vācu uzbrukumu laikā.
Paša ģenerāļa J. Kureļa liktenis gan bija citādāks. Lai arī 14. novembrī viņu arestēja kopā ar pārējiem virsniekiem, vēlāk pēc F. Jekelna štāba priekšnieka pavēles viņu atbrīvoja un ļāva atgriezties pie ģimenes Valdemārpils apkārtnē. Pēc četrām dienām viņu arestēja atkal un kopā ar ģimeni nogādāja Liepājā, no kurienes J. Kureli kopā ar ģimeni aizveda uz Dancigu, pirms ceļa paziņojot, ka nošauti viņa štāba virsnieki.
Dancigā viņu sagaidīja Latviešu leģiona ģenerālinspektors Rūdolfs Bangerskis. Kā raksta profesors H. Biezais, sagaidīšanas aina bija traģikomiska: R. Bangerskis, bijušais Latvijas armijas ģenerālis, tērpies SS grupenfīrera formas tērpā, sagaidīja J. Kureli, kurš bija tērpies Latvijas armijas ģenerāļa uniformā.
Sagaidīšana nebija laipna – R. Bangerskis J. Kurelim asi pārmetis nesadarbošanos ar vācu varas iestādēm, leģiona augstākie virsnieki J. Kurelim garām gājuši šņākdami, bet pats ģenerālis pratināts kā kareivis. Tomēr J. Kurelis palika brīvībā, oficiāli skaitīdamies komandēts Leģiona ģenerālinspektora štāba rīcībā līdz turpmākam rīkojumam. 1945. gada janvāra beigās Danciga tika evakuēta, ģenerālis J. Kurelis prasījis, lai līdz ar ģenerālinspektora štābu evakuē arī viņu un ģimeni, bet tas ticis rupjā veidā atteikts. Rezultātā J. Kurelim ar kājām un pārvarot lielas grūtības vienatnē ar lielām grūtībām izdevies izbēgt no strauji tuvojošās Sarkanās armijas, taču sievu ar bērniem viņš ieraudzīja tikai pēc diviem gadiem, kad viņi no padomju okupācijas zonas izbrauca uz pagaidu dzīves vietu Šlēzvigā-Holšteinā.
1951. gadā J. Kurelis ar ģimeni emigrēja uz ASV, Čikāgu, kur 1954. gada 5. decembrī mira.